apache服务器调用linux下程序问题，请指教

happybird1

我有个linux程序包,想利用apache做个网页让不会使用linux的人通过在网页中输入相应参数就可以使用此程序包。
我现在用php的system函数来运行此程序包的初始化程序，然后再运行包中的单个程序。但我在PHP中运行初始化程序后，第二个system("单个程序")无法运行（此软件包中的程序必须先运行初始化程序才能运行），我想原因可能是PHP运行完初始化程序后，第二个system("单个程序")调用了linux的命令，而不是已经初始化的环境下运行，想请教一下如何实现我的目的，非常感谢。(我把初始化程序和单个程序放在一个shell脚本中可以实现我的目的，但我的程序包里的每个程序都有很多参数，这样shell脚本写起来太麻烦，想找一种简单的方法，多谢)
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